在《破邪论》中，法琳论述了佛家与儒家不仅有共同之处，甚至犹有过之，都主张要以五常（佛教中对应的是五戒）来作为行为处事标准，儒家以五常作为人之为人的标准，而佛家则甚至把五常作为来事仍可为人的先决条件。他认为佛家只是形式上割舍亲情、君臣等，但是为了寻找众生脱离苦海的“大顺”：
《破邪论》：虽形阙奉亲而内怀其孝，礼乖事主而心戢其恩。泽被怨亲，以成大顺，福沾幽显，岂拘小违。
不仅如此，他还着书《辩正论》对《十异九迷论》进行反驳，可谓寸土不让。
对道家，其实唐朝初期是和隋朝时期完全不同的态度的。尽管两个朝代间隔时间很短，李渊、李世民等更是曾经在隋朝为官，但完全不同于隋文帝对佛教的狂热，他们选择了尊崇道教、并扶持道家的发展。李渊在位时，便认老子李聃为李唐王朝的祖宗。
武德八年，李渊下诏确定了道教在先、佛教在后的宗教基本策略：
老教孔教，此土先宗，释教后兴，宜从客礼。令老先、次孔、末后释宗。
到了李世民在位后，贞观十一年，李世民出于扶持道教发展需要，再次颁布了《令道士在僧前诏》，再次重申了道教在先的地位：
……至于称谓，其道士女冠，可在僧尼之前。
当然，与李渊想比，李世民对道家的支持更为明显，比如他曾经在亳州、兖州等地修建了道家宗庙，还专门安排了经费、人员。
可以说，道教在这时迎来了蓬勃发展时期。
其实，从社会现实来看，当时佛教已经发展到一个高峰，一句“南朝四百八十寺”道出了佛教的发展迅猛。如果说隋朝是佛教的蜜月期的话，那么唐朝初期，尤其是李渊在位时期，对佛教就不是那么友好了。
李渊登上九五之尊后，不仅如上文所述直接以诏令形式排定了佛教居后的地位，还在武德九年三月下诏《沙汰佛道》，尽管诏书中肯定了佛教的作用，但是对佛教的弊端揭露更多，比如诏书中指出，佛教有“浮惰之人，苟避徭役，妄为剃度”等弊端。而且，由于当时佛教势力较大，虽然道教也在沙汰之列，但客观上却起到了扶持道教的作用。根据《沙汰佛道》诏书，只京师留三寺千僧，其余寺宇并赐王公，僧徒放还故乡，可以说若按照此举，佛教发展将被严重打压。
然而，这时候事情出现了转机，由于当年的6月3日，爆发了玄武门事变，李渊被迫退位，李世民即位后为尽快稳定局势和争取原有李建成、李元吉势力选择了大赦天下，于是佛教又重新恢复了原来的模样。
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